Cada ID deve elaborar cadernos de atividades que são aplicados nas escolas parceiras do programa. A elaboração de um caderno é feita sob orientação de um dos professores orientadores do PIBID e segue quatro fases: uma pesquisa em nível de terceiro grau sobre determinado assunto escolhido pelo ID e sobre os conceitos matemáticos subjacentes; classificação dos tópicos essenciais e secundários a partir da pesquisa; transposição didática e elaboração das atividades; redação do caderno com três partes, a saber: o resumo teórico, indicações para aplicação das atividades e o elenco das atividades.
As atividades propostas são de cunho investigativo e seguem a metodologia de resolução de problemas. Assim, ao resolvê-los, o aluno protagonisa a construção do seu próprio conhecimento.

Cada bolsista ID se reúne um vez por semana com seu orientador para discutir a pesquisa que fundamenta a elaboração do seu caderno. Nesta reunião, ID e orientador discutem a respeito da última intervenção do ID em sala de aula, os problemas encontrados e suas soluções, assim como o planejamento da próxima intervenção na escola.

Fora as atividades presenciais, cada ID deve prepara os materiais para sua intervenção semanal na escola e desenvovler a pesquisa relativa à elaboração do seu caderno. 

Uma vez por semana, cada ID aplica os cdernos desenvolvidos no PIBID em uma turma de 10 a 12 alunos de uma escola da rede pública (CEAN, CED 03 ou Paulo Freire). Esta intervenção é supervisionada pelos professores supervisores da escola.

Toda sexta-feria, das 14 horas às 16 horas, temos uma reunião de formação com todos os bolsistas, os orientadores e o coordenador. Nessas reuniões, lemos textos sobre educação matemática e debatemos os conteúdos lidos à luz das nossas experiências em sala de aula.

Na última terça-feira de cada mês, os IDs e o coordenador se reunem para discutir assuntos administrativos.